1、清除雜物

在大棚室內的瓜果蔬菜收獲之后，在歇棚的時候（時間大多在6-8月夏季高溫時）將大棚內的作物殘株枯枝、病果落葉、雜草殘膜、雜物等全部清除到棚外，同時，對大棚內剩余的作物或雜草根系等，也要全部清除，并集中焚燒或深埋，使土地平整。

將大棚內的所有通風口都封閉起來，對漏風的部位也要完全封閉，以保證大棚內快速升溫，進行干燥悶棚一星期。

2、進行深翻施肥

在干燥悶一星期之后，把腐熟的雞糞或牛糞或豬糞等有機肥料，小麥或玉米秸稈，將秸稈切成3-5 cm的碎塊，鋪成5-10 cm的厚度，將其均勻地撒施在表面，并均勻地撒施1層石灰氮（或者用生石灰），石灰氮的用量一般是每畝60-100 kg，之后要對土壤進行25-30 cm的深翻耕（種淺根系的作物可以翻耕25-30 cm，種深根系的作物則要深翻35-40 cm）。

3、大水漫灌

接著進行大水漫灌，水位要高于地面3-5厘米。在隨后的高溫悶棚中，灌溉水量的多少與殺菌、殺蟲的效果有直接的關系，灌溉水量太少，則消毒、殺蟲的效果不好，灌溉水量太多，則不利于棚內土壤溫度的升高。根據實驗結果，在土壤水分含量為60~65%的情況下，采用高溫封閉大棚，其總體效果最佳。

4、覆蓋地膜

要嚴格保證溫棚的密閉性，將棚室的所有風口都要封閉起來，對漏風的部位都要進行堵塞和密封，以免棚室內溫度達不到對應的溫度，以保證棚室快速升溫。用舊的薄膜或地膜，將土壤徹底封住，接著，在大棚內升溫悶棚，使地面10 cm土壤溫度達到70℃，20 cm厚土溫度達到45℃，在高的地溫下，殺菌率達到80%。在封閉大棚和悶整之前，可以給大棚內噴灑一次消毒殺蟲劑，將大棚內、墻角和縫隙里的細菌和昆蟲全部殺死。

5、根據實際情況延長悶棚時間

在悶棚時間上，建議持續15-25天（新棚15天左右，老棚20天左右，如遇連續多云天氣，需適當延長悶棚時間）。在較高的溫度下，較長的保溫時間，有利于達到更好的滅菌和徹底的效果。大部分病原菌不耐高溫，一般只需10天以上的熱加工就能殺滅，例如黃瓜菌核病、茄子黃萎病菌等病原菌不耐高溫。但也有一些病菌具有很強的耐熱能力，比如根腐病病菌、枯萎病病菌等深根性土傳病菌，因為它們存在的土層比較深，需要30-50天的時間才能起到良好的作用。因此，要延長高溫悶棚時間，提高溫度，特別是對根線蟲等比較嚴重的地塊，必須將表土下10厘米的土溫提高到55℃以上才能殺滅。所以，在對大棚土壤進行滅菌時，要根據大棚種植的農作物和對應的病原菌的耐熱性來決定滅菌的持續時間。

6、補充益生菌肥或菌劑

悶棚完成后，特別是通過加藥來悶棚的棚室，悶棚后要立即揭棚通風晾曬5-7天。在高溫封閉大棚的時候，土壤中的有益菌和有害菌都被殺死了，所以土壤中的細菌數量會相對“空”起來。為要讓有益細菌占據土壤的空間，壓縮有害細菌的繁殖空間，在作物播種之后，減少細菌對作物的傷害，要把握好高溫悶棚后的有利時間，及時、充足地補充生物菌肥或菌劑，以提高土壤中的有益細菌的數量。所以，在高溫悶棚后，以及下茬作物種植之前，一定要及時補充生物菌肥，比如枯草芽孢桿菌、木霉菌等有益菌種。不然，在悶棚后，如果沒有及時補充菌肥和菌劑，作物種植后，根系很容易受到病菌的攻擊，從而引發更嚴重的疾病。尤其要注意的是：生物菌肥或菌劑，不能在高溫悶棚前施用，必須在高溫悶棚后施用，不然有益生物菌會被悶棚時的高溫完全殺死。